NTFS和ＦＡＴ32 ??
FAT32与NTFS的区别:
1、大硬盘带来的影响。现在的硬盘容量正以倍数在增长，每半年就增加一倍甚至更多，价格却在降低。这样基于传统的FAT文件系统的分区方式，就将逐步体现出其先天不足之处了——我们先来看看FAT32，FAT32是FAT文件系统的增强版本，可用在容量为512MB到2TB的驱动器上，虽然如此，以FAT32的格式，如果划分太大的分区空间，由于其磁盘的簇相对过大，在储存多个小文件的时候，将造成空间利用上的极大浪费。相对而言，NTFS的磁盘格式的簇相当地细，就能有效地利用磁盘空间，而且不容易产生碎片。另外，NTFS的磁盘格式在处理单个巨大的文件的时候如进行视频捕捉、编辑的时候，也比FAT系统有优势。随着海量硬盘的发展，使用NTFS的分区格式将越来越必要——你总不希望把分区数划分满24个字母的盘符来迁就分区容量吧？所以，微软推荐使用NTFS而不是FAT32文件系统格式化大于32GB的分区是有其道理的。
2、新一代Windows操作系统的影响随着时间的推移，新一代Windows的过渡，微软很可能会采取放弃兼容DOS的安装和维护操作系统的方式，即光盘启动后直接采用全新的直接图形化界面进行下几代Windows的安装，这样可以避开DOS模式的内存配置环境对安装Windows造成的负面影响，也可让很多破解其激活设置的程序失效（DOS环境下内存配置对新手来说比较复杂，很多人安装XP失败除了硬件兼容问题外，是由于这个原因）；同时对最终用户来说，新的安装模式可在安装的时候更好地分析用户的硬件系统，提供更多的友好提示和更强的故障解决功能。使用图形界面直接管理安装任务的话，基于第一点叙述的原因，Windows很可能会要求用户用NTFS先格式化新一代海量硬盘超过32G的分区，才能继续进行安装。也可能通过在新的操作系统里去掉对FAT系统的支持，来强行推广NTFS磁盘格式。3、联网和多PC连接导致的用户安全和管理问题以后的电脑进行在线工作和娱乐是不可逆转的趋势，随着互联网在世界各地进一步普及，在线的电脑的安全和管理问题日益突出，而且很多人家里由于升级，已经有超过了一台的电脑。只有使用NTFS，Windows系统的安全性能和可管理性才能真正得到保障。无论是接入INTERNET还是用户自己在家里组建局域网，NTFS都将使用户更灵活地配置和管理计算机资源。NTFS的磁盘配额、用户权限和个人文件加密等等功能、和网络应用方面的优势，已经有很多资料介绍了，此处不再重复。另外，NTFS支持基于UNIX服务的POSIX标准，可移植性也很强。这保证了它和其他网络平台的兼容性。当然，这一切的前提是Windows还是占垄断地位的操作系统。从目前情况看，微软保持其软件业龙头的地位还是不成问题的。超过500G的海量硬盘在明年年底或是后年初就可能会出现了，这是推动NTFS磁盘格式成为主流分区格式的最强大动力之一。由以上的几点可看出，针对家用PC而言，使用NTFS的最大的好处是第一点，也就是NTFS对大硬盘有着更好的支持与利用，第三点主要是针对商业型用户，这里我也想对那些入门级用户说一声，如果你使用了NTFS且对NTFS的磁盘配额、用户权限和个人文件加密等等功能不是很了解，最好不要随意设置目录的权限，不然可能会有着意想不到的后果。
看自己的用途，我这里给你介绍一下两者的好处坏处：
NTFS的好处：1. 支持大文件，FAT32文件系统不支持4G以上的文件，如果你需要下载巨大文件，则无法将那个文件保存在FAT32分区
2.独特的兼容性，新游戏完美支持NTFS，老游戏就不一定了，某些加密的游戏必须在NTFS分区中安装，这样才能躲过Starforce
3.较少磁盘碎片
4.压缩，加密，MBR，你会发现，存在NTFS分区中的文件属性多，NTFS区中的MP3文件可以在文件中携带歌词等附加信息。不过，除非你非常在意保密，NTFS加密最好别用
FAT32的好处：
1.跟Windows98/ME，DOS7兼容，方便DOS下系统维护
2.老游戏支持较好
其实37G以上分区，NTFS效率很高
当然，10G左右的分区，FAT32也可以，不过开启压缩卷后，NTFS仍然更省空间（压缩卷容易导致冲突）
具体的区别楼上的说的已经很清楚了,从你所说的情况来看,你使用的至少是WIN2000以上的系统,所以建议你选NTFS格式,至少系统所在分区应该使用这种格式
