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《在线蛋白质折迭游戏》(Foldit)[安装包]

王朝简介·作者佚名  2010-05-01  
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中文名称: 在线蛋白质折迭游戏

英文名称: Foldit

游戏类型: PUZ 益智类游戏

资源格式: 安装包

发行时间: 2008年05月

制作发行: 华盛顿大学的计算机科学和工程学系和生物化学学系联合共同开发

地区: 美国

语言: 英文

简介:

引用

【杀毒提示】

已通过安全检测:

安全检测软件:Avira AntiVir Personal

版本号:9.0.0.11

病毒库发布时间:2010-04-28

引擎版本:8.02.01.224 (20100421)

引用

【安装/卸载】

一般步骤安装/卸载。

【官方网址/注册网址】

http://fold.it/portal/

Foldit是一个实验性的蛋白质折迭电子游戏,由华盛顿大学的计算机科学和工程学系和生物化学学系(同一批人中,很多人也参与创建Rosetta@home)联合共同开发。第一个beta公开测试版在2008年5月释出。

Foldit让全世界的玩家比赛设计蛋白质,而科学家们则可以研究玩家设计的蛋白质,看看是否能运用到新药中。

该程序让用户在工具辅助解谜,就能够得出实际的蛋白质模型。每当结构被变动,一个"分数"会根据折迭的完善程度给出。Foldit用户可以创立加入小组,分享各自的方案。也有小组高分榜。

生物制造主要蛋白质结构的方式(蛋白质生物合成)在理性上已经为人类所了解,此即蛋白质DNA 测序的方法。决定蛋白质主要结构转化为功能性三围结构(蛋白质分子如何“折迭”)是更为困难的;虽然大致的程序已经为人所知,但蛋白质结构预测还是需要大量的计算。

Foldit尝试利用人脑天生的三维pattern matching能力。目前该程序出的谜题都是基于已被人们清楚了解的蛋白质;通过分析人类在解这些谜题时的直觉思考途径,研究者希望能改进现有蛋白质折迭软件所用的算法。

开发者Popovic说,“我们的目标是让任何人都能操作,即使他们根本不了解生物化学或蛋白质折迭”。

目前,这个游戏只能使用那些三维结构已被研究人员解决的蛋白质。

但Popovic说,“不久之后会引入我们还不知道解决之法的蛋白质”。

Foldit是结合众包与分布式计算所得的成果。

【游戏截图】

【发布者的话】

看大家的回复,觉得大家对游戏的热情不高啊!

而且还有很多同学认为游戏只是给科学家玩的啊...囧~

所以,来段引用的文字吧~

译文链接: http://songshuhui.net/archives/17292.html

原文链接: http://songshuhui.net/archives/4405.html

引用

阿瑞思泰德斯是个普通的13岁男孩。放学后打篮球,学习单簧管,到了晚上就坐到电脑前玩游戏。有个游戏让他特别着迷,也让他在同龄人中显得与众不同。每天,他都会用“奶酪”这个昵称登录www.fold.it, 他玩的这个游戏需要弯曲、拉伸和扭动一个有些像大树根系那样的3维结构。通过调节这些扭动的绿色小管儿的长度,他要设法将它们的体积最小化。这看上去不过就是个有点奇怪的游戏——顶多就有些类似3维俄罗斯方块——但实际上,脱去游戏这层鲜艳的外衣,它蕴含着当今生物学家们面临的最大难题之一:蛋白质是如何折迭的?

而阿瑞思泰德斯摆弄的那个3维结构就是通过电脑所呈现的真实蛋白, 比如胶原蛋白分子。不需要知道分子生物学最基本的知识,他一样能够帮助解决现代科学里最棘手的难题之一。这个游戏的发明者,西雅图华盛顿大学的戴维•贝克(David Baker)说道:“在无数多种可能的情况下,要用计算机准确预知一个长蛋白质链是如何用最简洁紧凑的方式折迭,是一个相当困难的问题。

随着蛋白质肽链长度的增加,它可能的折迭方式也指数式地增加。即便是最简单的链条,也需要让一台标准台式计算机花上几个世纪的时间去预测最佳折迭方式。而有了60 000名像阿瑞思泰德斯一样的业余玩家,仅仅运作了六个月的Foldit游戏,就得到几十种蛋白的折迭方式了。

......

蛋白质的无数种折迭的方式正好是计算机所无法理解的,他说道。像阿瑞思泰德斯这样的玩家证明了有技术的人类是如何准确地将蛋白质进行准确折迭。游戏进行几个月之后,阿瑞思泰德斯从全球60000名玩家中脱颖而出,名列前十,并被邀请加入Foldit的高级组。他展示出了对微妙的力学问题的如此直观的理解,一位Foldit研究员将他称作“Foldit学者”,最近他飞往西雅图,告诉他们自己是如何解决蛋白质难题的。

 
 
 
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