系统生物学导论--生物回路的设计原理
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作者： （以色列）阿隆著，王翼飞等译
出 版 社： 化学工业出版社
出版时间： 2010-4-1字数： 335000版次： 1页数： 256印刷时间： 2010-4-1开本： 16开印次： 1纸张： 胶版纸I S B N ： 9787122070258包装： 平装
本书首次对系统生物学研究工作的核心和细节进行深入阐述，为直观理解生物学中一般原理建立了基础。全书内容编排体现了下列特色：
对网络模体等新的理论研究成果做了细致深入的阐述，指出了系统生物学的核心内容和实践方法；
阐明了转录调控、信号转导、发育网络中的基本回路；
检测了鲁棒性原理；
清晰地说明了如何用进化优化来理解最优回路设计；
仔细考虑了动力学校正和其他机制是如何使生物信息处理中的误差减到最少的；
包括了习题、问题的解答以及关于背景材料的附录。
本书对于初涉系统生物学研究的读者理解和领会这门学科的内涵会有很大帮助，可以作为系统生物学研究的热门参考书，更可作为相关学科的高年级本科和研究生教材。
第1章绪论
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第2章转录网络：基本概念
2.1引言
2.2细胞的认知问题
2.3转录网络中的元件
2.3.1时间尺度分离
2.3.2边上的符号：激活剂和阻抑物
2.3.3边上的数字：输入函数
2.3.4逻辑输入函数：一个理解网络动力学的简单框架
2.3.5多维输入函数调控具有几个输入的基因
2.3.6小结
2.4简单基因调控的动力学和响应时间
2.4.1稳定蛋白质的响应时间是一个细胞世代
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习题
第3章自身调节：一种网络模体
3.1引言
3.2模式、随机化网络及网络模体
3.2.1与随机化网络比较发现网络模体
3.3自身调节：一种网络模体
3.4负自身调节网络加快基因回路的响应时间
3.5负自身调节可增强生成速率波动的鲁棒性
3.5.1正自身调节延缓响应且能导致双稳态
3.6总结
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习题
第4章前馈环网络模体
4.1引言
4.2子图在随机网络中出现的次数
4.3前馈环是一个网络模体
4.4前馈环基因回路的结构
4.5具有逻辑“与”的协调1型FFL的动力学
4.6C1FFL是一个信号敏感的延迟元件
4.6.1在Sx的ON跳变后的延迟
4.6.2在Sx的OFF跳变后没有延迟
4.6.3C1FFL是一个信号敏感的延迟元件
4.6.4信号敏感延迟能防止短暂的输入波动
4.6.5大肠杆菌的阿拉伯糖系统中的信号敏感延迟
4.6.6“或”门C1FFL对Sx的OFF跳变是信号敏感延迟的
4.6.7小结
4.7非协调1型FFL
4.7.1非协调FFL的结构
4.7.2I1FFL的动力学：一个脉冲发生器
4.7.3I1FFL加快了响应时间
4.7.4响应加速是信号敏感的
4.7.5I1FFL动力学的实验研究
4.7.6加快响应的三种方法（小结）
4.8为什么有些FFL类型是稀有的？
4.8.1I1FFL的稳态逻辑：Sy能开启高表达
4.8.2I4FFL，一个稀有的选择回路，拥有简化的功能性
4.9FFL的趋同进化
4.10总结
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习题
第5章时间程序与转录网络的整体结构
第6章发育、信号转导及神经网络中的网络模体
第7章蛋白质回路的鲁棒性：细菌趋化性的例子
第8章发育中的鲁棒模式形成
第9章动力学校正
第10章最优的基因回路设计
第11章基因调控的需求规则
第12章结束语：生物学中的简单性
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附录
词汇表
参考文献
中文索引
英文索引
