《生物技术设计工具》(ReCore v1.8.14)[光盘镜像]
中文名: 生物技术设计工具
英文名: ReCore v1.8.14
资源格式: 光盘镜像
发行时间: 2009年
制作发行: biosolveit
地区: 美国
语言: 英文
简介:
语言：英语
网址：http://www.biosolveit.de/ReCore/
类别：生物技术设计工具
与传统药物化学致力于产生活性化合物的类似物的策略不同，核心迁越通过保留一个潜在的先导化合物的活性，搜索新的骨架。这个策略中使用的计算工具的目标是与结合相关的性质，而不是与化学结构相关的性质。
基于片段的设计策略可以被用来对骨架迁越提供支持。BioSolveIT 公司CEO Christian Lemmen说，利用计算机的配基设计的主要困难是“能否对结合亲和性进行准确预测的问题以及检测低亲和性结合物的能力的问题，这些问题在对于片段的情况下是经常出现的。”他解释到，BioSolveIT的ReCore是一个基于配基的设计工具，“这个工具通过仅仅选取连接核心片段与其R-基团的向量进行配基结构的提取。”
如其名字所寓意的，ReCore定位并去除分子的核心，并且在3D-片段库中寻找合适的替代核心，形成一个新的骨架。在这个过程中保持周围的部件不变以产生一个化学上不同的查询化合物。ReCore是Patrick Maass在汉堡大学的生物信息学中心与.罗氏公司合作开发的。这个软件的开发人员最近把它应用在基于小分子晶体结构构象的骨架迁越上（J. Chem. Inf. Model. 2007; doi: 10.1021/ci060094h）。
安装说明
安装后将patch复制到安装目录 \Recore\recore\下。
引用
Unrar, Mount/Burn, Install.
Put the patch in the <install dir>\Recore\recore\ and run it.
Note: The program contains RecoreGUI which is/has been a beta for quite
some time, but the main exe is not beta.
nethero@TLF-ED => 806.2MB
NFO:
代码
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▀▀▀ Nearing the edge of the galaxy
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ReCore v1.8.14 (c) BioSolveIT
Type ..... : Molecular
Date ..... : 03/2009
Size ..... : 57x15MB
OS ....... : Windows
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ReCore is a computer program for scaffold hopping and core replacement:
You have a 3D structure of a ligand. ReCore can replace an unwanted part
(defined by bond cuts) so that the new part respects the dangling bonds
as good as possible. Additionally, user-defined "pharmacophore features"
can be employed to direct the search.
A typical workflow is a two stage process, of which Stage A needs to be
performed only once:
Stage A: Shredding of libraries and creation of an index for fast search
Stage B: Searching the fragment library using a query and the database
exploiting the index.
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░▓█████████████████████▓░ [ INSTALLATION ] ░▓██████████████████████▓░
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Unrar, Mount/Burn, Install.
Put the patch in the <install dir>\Recore\recore\ and run it.
Note: The program contains RecoreGUI which is/has been a beta for quite
some time, but the main exe is not beta.
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░▓████████████▓░ [ Nearing the edge of the galaxy ] ░▓████████████▓░
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This is for evaluation purposes. If your like the software, go buy it.
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