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基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(七)第五章 结束语生物信息学是计算机科学、数学、生物学等学科的新兴交叉学科,DNA序列测定是生物信息学研究的一项基础性工作。目前大规模全基因组序列测定中常采用shotgun和BAC测序方法,片段拼接是该方法中...查看完整版>>
基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(七)
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基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(六)4.3.1 程序的结构Atlas-prep-read1.create index file atlas-createindex</perl/bin >(perl程序)2.split fasta and quality files into 20,000 reads sub files if necessary then screen and trim 1...查看完整版>>
基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(六)
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基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(五)第四章 Atlas程序的分析与改进4.1 数据的准备一个完整的拼接程序应该分为两个部分,一个是数据的准备,另一个是数据的拼接。一般数据的准备分为以下几个过程4.1.1 片段的调整(trimming reads)片段之所以要调整...查看完整版>>
基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(五)
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基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(四)第一章 Atlas的安装与调试3.1 程序的获得 Atlas是一个用于大型基因序列拼接的程序,可以用于全基因shotgun序列拼接(WGS),也可以用于BAC和WGS混合read的拼接。使用这个系统...查看完整版>>
基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(四)
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基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(三)第一章 基因组测序与DNA序列拼接简介2.1 基因组测序与序列拼接算法研究2.1.1 基因组的概念众所周知,生物由细胞组成,而细胞中含有一种与遗传有关的高分子化合物,称为脱氧核糖核酸(...查看完整版>>
基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(三)
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基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(二)第一章 概述1.1 什么是生物信息学1.1.1 前言 2000年6月26日是人类科技史上一个令人难忘的日子,参加者人类基因组计划研究,美国、英国、法国、德国、日本和中国科学家同时向世界宣布...查看完整版>>
基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(二)
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基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(一)前 言生物信息学(bioinformatics)是80年代未随着人类基因组计划(Human genome project)的启动而兴起的一门新的交叉学科。它涉及生物学、数学、计算机科学和工程学,依赖于计算机科学、工程学和应用数学的基础,...查看完整版>>
基于WGS和CBC测序策略的DNA序列拼接算法研究(一)
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[原创]基于Win2000服务器文件共享管理策略研究关键词: win2000 Server,共享权限管理,Active Directory 概述基于win2000的文件夹共享对于满足相对简单的企业应用仍然是一种很好的知识管理解决方案。即便是对于存在知识管理系统的企业,也可以作为知识管理系统的...查看完整版>>
[原创]基于Win2000服务器文件共享管理策略研究
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美研究基因测序新手段美国多家公司和研究所正致力于研究基因测序新手段。研究人员预计,未来20年左右就会出现桌上型甚至掌上型的快速基因分析仪器。 加州应用生物系统公司的生物学家说,人类基因组实际上是由32亿个左右的碱基对组成的...查看完整版>>
美研究基因测序新手段
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基于Windows DNA的三层应用基于Windows DNA的三层应用 摘要 本文回顾了应用模型的发展过程,介绍了当前三层应用模型的结构及其优势,以及如何在windows平台上构建基于这一新的模型的应用,并给出了一个实例。关键词 三层应用 3-tier Cli...查看完整版>>
基于Windows DNA的三层应用
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